Número 1 - Produção Pesqueira Marinha do Estado de São Paulo 1998-1999
Número 2 - Programa de Desenvolvimento da Criação Ordenada de Moluscos Bivalves no Estado de São Paulo
Número 3 - A Sustentabilidade das Atividades de Aqüicultura e Pesca
Número 4 - Programa Integrado de Extensão Pesqueira
Número 5 - Adequação da Estrutura Organizacional e do Gerenciamento Institucional da Pesquisa
Número 6 - Programa de Ação do Pólo Especializado de Desenvolvimento Tecnológico do Agronegócio do Pescado Marinho. Anexos 
Número 7 - Desempenho de Dois Lotes de Tilápia do Nilo, na Região do Vale do Ribeira, SP 
Número 8 - Levantamento da pesca profissional continental, no Estado de São Paulo, de 1994 a 2000. Dados preliminares. I. Bacia do Rio Paraná. (Veja Tabela)
Número 9 - Levantamento da pesca profissional continental, no Estado de São Paulo, de 1994 a 2000. Dados preliminares. II. Bacia do Rio Grande.  (Veja Tabela)
Número 10 - Levantamento da pesca profissional continental, no Estado de São Paulo, de 1994 a 2000. Dados preliminares. III. Bacia do Rio Paranapanema. (Veja Tabela)
Número 11 - Produção pesqueira marinha do Estado de São Paulo no ano 2000
Número 12 - Produção pesqueira marinha do Estado de São Paulo no ano 2001
Número 13 - Produção pesqueira marinha do litoral sul no período de 1967 a 1994
Número 14 - Produção pesqueira marinha do Estado de São Paulo no ano 2002
Número 15 - Produção pesqueira marinha do Estado de São Paulo no ano 2003
Número 16 - Produção pesqueira marinha do Estado de São Paulo no 1º e 2º trimestres do ano 2004
Número 17 - Levantamento da pesca profissional continental no Estado de São Paulo, em 2001. - Dados preliminares: Bacias dos rios Paranapanema, Paraná e Grande
Número 18 - Produção pesqueira marinha do litoral sul do Estado de São Paulo no período de 1995 a 2002 - Projeto Sul Paulista
Número 19 - Produção pesqueira marinha do Estado de São Paulo no 3º trimestre do ano 2004
Número 20 - Produção pesqueira marinha do Estado de São Paulo no ano 2004
Número 21 - Situação atual da cadeia produtiva do pescado no litoral do Estado de São Paulo
Número 22 - Levantamento da Pesca Profissional Continental no Estado de São Paulo, em 2002
Número 23 - Levantamento da pesca profissional continental, no Estado de São Paulo, em 2003. - Dados preliminares: Bacias dos rios Paranapanema, Paraná e Grande
Número 24 - Levantamento da pesca profissional continental, no Estado de São Paulo, em 2004. - Dados preliminares: Bacias dos rios Paranapanema, Paraná e Grande
Número 25 - Levantamento da pesca profissional continental, no Estado de São Paulo, em 2005. - Dados preliminares: Bacias dos rios Paranapanema, Paraná e Grande
Número 26 - Produção pesqueira marinha do Estado de São Paulo no ano 2005
Número 27 - Alimentação da guaivira Oligoplites saliens (Bloch, 1793) (Perciformes: Carangidae) proveniente da pesca na região de Cananéia-SP
Número 28 - Abordagem histórica da pesca da tainha Mugil platanus e do parati Mugil curema (perciformes: mugilidae) no litoral norte do Estado de São Paulo
Número 29 - A pesca de arrasto-de-praia na ilha de São Vicente, São Paulo, Brasil
Número 30 - A pesca da tainha Mugil platanus (Perciformes: Mugilidae) desembarcada no litoral de São Paulo - subsídio ao ordenamento
Número 31 - A atuação de grandes embarcações pesqueiras na região costeira: o conflito de uso no litoral norte do estado de São Paulo
Número 32 - A utilização do ambiente marinho e de seus recursos vivos pela frota pesqueira paulista: o ambiente demersal
Número 33 - Mapeamento da pesca artesanal ao longo do médio e baixo rio Tietê (São Paulo, Brasil)
Número 34 - A pesca de cerco-flutuante na Ilha Anchieta, Ubatuba, São Paulo, Brasil
Número 35 - Levantamento da pesca profissional continental, no Estado de SãoPaulo, no ano 2006. Dados preliminares: Bacias dos Rios Paranapanema, Paraná e Grande
Número 36 - Levantamento da pesca profissional continental, no Estado de São Paulo em 2007. Dados preliminares: Bacias dos Rios Paranapanema, Paraná e Grande
Número 37 - A pesca extrativa no Reservatório de Jurumirim, Rio Paranapanema, em dois períodos distintos, 1973 a 1977 e 1994 a 1998, São Paulo, Brasil
Número 38 - Produção pesqueira do Reservatório Billings (Bacia do Alto Tietê – SP) nos anos 2005, 2006 e 2007
Número 39 - Ecorotulagem de pescado e de produtos pesqueiros da pesca extrativa marinha
Número 40 - Sobre a técnica construtiva da arte de pesca de Cerco-Flutuante no litoral norte de São Paulo, Brasil
Número 41 - Levantamento da pesca profissional continental, no Estado de São Paulo, em 2008. Dados preliminares: bacias dos rios Paranapanema, Paraná e Grande
Número 42 - Estudo da produção pesqueira do médio rio Tietê, nos anos de 2003 e 2004
Número 43 - A extensão pesqueira no Estado de São Paulo: um instrumento para a gestão da pesca paulista de pequena escala
Número 44 - Plano de extensão rural e pesqueira para o litoral paulista
Número 45 - Produção pesqueira do baixo Rio Tietê, nos anos de 2003- 2004
Número 46 - Levantamento da pesca profissional continental no Estado de São Paulo, em 2009. Dados Preliminares: Bacias dos Rios Paranapanema, Paraná e Grande
Número 47 - As medidas de comprimento e arqueação das embarcações de pesca
Número 48 - A instrumentação oceanográfica de pesquisa pesqueira no acervo do Museu de Pesca
Número 49 - Contribuições ao processo de ordenamento da pesca da espécie Mugil liza (Teleostei: Mugilidae) nas regiões sudeste e sul do Brasil entre os anos 2006 e 2010
Número 50 - Avaliação do seguro defeso concedido aos pescadores profissionais no Brasil
Número 51 - Avaliação da situação das populações de peixes consideradas ameaçadas de extinção por meio de consulta ao setor produtivo pesqueiro do estado de São Paulo
Número 52 - Aspectos socioeconômicos e produtivos dos pescadores da Baixada Santista que atuam nas áreas possivelmente impactadas pela dragagem de aprofundamento do canal do porto de Santos-SP e na área de deposição de material dragado
Número 53 - Atividade pesqueira e comunidades tradicionais de pescadores nos municípios de Ilhabela e São Sebastião, com ênfase ao canal de São Sebastião

Número 55 - O caranguejo-uçá, Ucides cordatus, como recurso pesqueiro no litoral centro de São Paulo: uma iniciativa de gestão